Medizinische Bildverarbeitung (SS2013)

Einf├╝hrung in die medizinische Bildverarbeitung

Zeit und Ort:

Montag17:45 - 19:15, D14/403
Freitag12:00 - 13:30, D14/403 (nur x-Woche)

 

Update: Die Vorlesung am 03.05.2013 findet in D15 / 004 statt!

Vorlesungsmaterialien: 

  • (25.03.) Organisation
  • (25.03.) Einf├╝hrung 
  • (05.04.) ITK & Pipeline
  • (08.04.) Bilder, Darstellung & elementare Operationen, Beweis Assoziativit├Ąt der Faltung
  • (15.04.) Filter, Fourier Transformation
  • (19.04.) Kantendetektoren
  • (22.04.) Kantendetektoren II
  • (29.04.) Registrierung, MATLAB Function: Joint Histogram
  • (03.05.) Registrierung II - ICP Algorithmus, Wahrscheinlichkeit, Entropie und Mutual Information, ICP-Algorithmus Berechnung (Zusammenfassung)
  • (06.05.) Resampling und Registrierung in ITK
  • (13.05.) Mutual Information, Probability Density Functions
  • (24.05.) Voxelbasierte Registrierung
  • (03.06.) Segmentierung - Region Growing, Cluster Analyse
  • (07.06.) k-means Verfahren, morphologische Watersheds
  • (10.06.) Live Wire Segmentierung
  • (17.06.) Matlab Algorithmen: Watershed mit Markern, Watershed 2D Demo, Watershed 3D Demo
  • (21.06.) Erweiterung der Live Wire Segmentierung (s. 10.06.)
  • (24.06.) Histogrammbasierte Clusteranalyse
  • (01.07.) Aktive und deformierbare Modelle
  • (05.07.) Mind Map

 

Praktikum:

Zeit und Ort:

Donnerstag08:30 - 10:00, D15/107

 

Optionaler Zusatztermin: Am 05.04. steht im 4. Block (nach der Vorlesung) das Labor D15/107 zur Verf├╝gung. Dieser Termin kann f├╝r die Installation von ITK/VTK genutzt werden.

 

Die Praktikumstermine entnehmen Sie bitte dem OBS. Bitte kommen Sie vorbereitet zum Praktikum. Die Aufgaben und Materialien werden Ihnen rechtzeitig zur Verf├╝gung gestellt.

Das Praktikum gilt als bestanden, wenn alle 6 ├ťbungen testiert sind.

Howto - Installation Qt, ITK, VTK, MITK

F├╝r die Pflichtteile der Praktika ben├Âtigen Sie lediglich ITK und VTK, optionale Aufgaben ben├Âtigen ggf. Qt/MITK.

Nr.ThemaMaterialien
Praktikum 1Entwicklungsumgebung, Datentypen, Lesen-/Schreiben von Bildern, Visualisierung, PixelzugriffCMakeLists.txt, Lena.png, LenaM.png, Landscape.png, BrainMidSagittalSlice.png, BrainProtonDensitySlice.png
Praktikum 2Zugriff auf Bilddaten, Elementare Operationen der med. Bildverarbeitungs. Praktikum 1, + Images.tar.gz
Praktikum 3Registrierungs. Praktikum 1, + BrainFixed.png, BrainMoving.png, BrainRotated.png, BrainT1Fixed.png
Praktikum 4Segmentierung s. Praktikum 1, + EyeSlice.png, HeadSlice.png, ImageSeries.tar.gz
Praktikum 5GUI, Mesh-Erzeugung, Live-Wire Segmentierungs. Praktikum 1 bis 4

 

Beispiele:

Links (Software):